2000 г., Том 5, Спец. выпуск, с.16-24

Для получения информации о структуре генов на основе анализа EST разработана программа ORFScan, позволяющая восстанавливать открытую рамку трансляции с использованием динамического программирования и множественного выравнивания этих последовательностей. С помошью программы Cap2 [21] формируется EST-консенсус, на основе которого восстанавливается открытая рамка трансляции и строится соответствующая ей аминокислотная последовательность. Существенной особенностью предлагаемой программы является использование при реконструкции открытой рамки считывания не только результирующего консенсуса, но и картины выравнивания EST в целом. Ошибки первого и второго рода при реконструкции открытых рамок трансляции не превышают 6 % и 4 % соответственно.