2000 г., Том 5, Спец. выпуск, с.87-99

Предложен обобщенный химико-кинетический метод моделирования, основанный на блочном принципе описания динамики функционирования биологических систем произвольной сложности в терминах элементарных процессов. Разработан алгоритм конструирования моделей сложной молекулярно-генетической системы из отдельных блоков, описывающих элементарные процессы. В рамках обобщенного метода построена динамическая модель онтогенеза фага [Java Applet] в клетке E.coli. В рамках модели описаны процессы репликации в [Java Applet]- и [Java Applet]-формах, транскрипция генов и трансляция мРНК, функции промоторов [Java Applet], [Java Applet], [Java Applet], [Java Applet], [Java Applet], [Java Applet] конститутивного терминатора [Java Applet], Q-регулируемого [Java Applet]-независимого терминатора транскрипции [Java Applet] и N-регулируемых [Java Applet]-зависимых терминаторов транскрипции [Java Applet], [Java Applet], [Java Applet], [Java Applet], [Java Applet], [Java Applet]-сайтов, а также функции белков exo, xis, beta, gamma, N, cI ([Java Applet]-repressor), cII, cIII, cro (tof, antirepressor), O, P, Q, S, R, контролирующих все основные этапы реализации генетической программы развития фага в клетке. Предложенный алгоритм конструирования моделей из подмоделей "генов" по заданной "генетической" карте позволяет рассчитывать динамику функционирования практически любого генетического варианта, который можно сконструировать из генов фага [Java Applet].