Портфолио аспиранта

ФИО: Сенотрусова Софья Дмитриевна

Гражданство: РФ

Дата и место рождения: 22.08.1993, г. Барнаул Алтайского края

Направление подготовки: 09.06.01 Информатика и вычислительная техника

Направленность: 05.13.18 – Математическое моделирование, численные методы и комплексы программ

Курс: 4

Научный руководитель: д.ф.-м.н. Воропаева Ольга Фалалеевна

Тема научно-квалификационной работы: Математические модели функционирования биомаркеров дегенеративных заболеваний и их приложения

Сроки обучения и ВУЗы по первым двум уровням высшего образования:
НГУ, бакалавр по направлению 01.03.03 механика и математическое моделирование, 2012-2016 г.г.
НГУ, магистр по направлению подготовки 01.04.03 Механика и математическое моделирование, 2016-2018 г.г.

Публикации в зарубежных рецензируемых журналах (Web of Science, Scopus)
1. Воропаева О.Ф., Сенотрусова С.Д., Шокин Ю.И. Дерегуляция p53-зависимых микроРНК: результаты математического моделирования // Математическая биология и биоинформатика. 2017, т.12, №1, с.151-175, doi: 10.17537/2017.12.151.
2. Воропаева О.Ф., Сенотрусова С.Д. Переход от уравнения с запаздыванием к системе обыкновенных дифференциальных уравнений в модели сети онкомаркеров // Математическое моделирование, 29:9 (2017), с.135–154.
3. Voropaeva O.F., Senotrusova S.D., Shokin Yu.I. Numerical investigation of diagnostic properties of p53-dependent microRNAs // RJNAMM,32(3), 2017, p. 203-213.
4. Сенотрусова С.Д., Воропаева О.Ф. Математическое моделирование функционирования положительной связи в системе онкомаркеров // СибЖВМ. 2019. т. 22. № 3. с. 325–344. doi: 10.15372/SJNM20190306
5. Воропаева О.Ф., Лисачев П.Д., Сенотрусова С.Д., Шокин Ю.И. Гиперактивация сигнального пути р53–микроРНК: математическое моделирование некоторых вариантов противоопухолевой терапии // Математическая биология и биоинформатика. 2019. Т.14. №1. С.355–372.
6. Сенотрусова С.Д., Воропаева О.Ф., Шокин Ю.И. Применение минимальных математических моделей динамики сигнального пути белка р53–микроРНК к анализу лабораторных данных // Вычислительные технологии. 2020. Т.25. №6. С.4–49.

Публикации в Российских рецензируемых журналах (из списка ВАК)
1.Воропаева О.Ф., Козлова А.О., Сенотрусова С.Д. Численный анализ перехода от уравнения с запаздыванием к системе ОДУ в математической модели сети онкомаркеров // Вычислительные технологии. 2016 , т.21, №2, с.12-25.

Др. публикации (статья в сборнике трудов конференции; журнал, рецензируемый в РИНЦ и пр.)
1. Воропаева О.Ф., Сенотрусова С.Д. Численное моделирование функционирования сети онкомаркеров // Труды международной научно-технической конференции «Актуальные проблемы прикладной математики, информатики и механики», Воронеж, 16-18 декабря 2015, с. 150-152.
2. Сенотрусова С.Д. Численное моделирование функционирования сети онкомаркеров // Материалы 54-й международной научной студенческой конференции, Новосибирск, 16-20 апреля 2016 г., с. 187.
3. Сенотрусова С.Д. Численное моделирование динамики сети онкомаркеров p53-микроРНК // Труды международной научно-технической конференции «Актуальные проблемы прикладной математики, информатики и механики», Воронеж, 12-15 сентября 2016, с. 278-281.
4. Воропаева О.Ф., Шокин Ю.И., Сенотрусова С.Д. Математическое моделирование функционирования сети онкомаркеров // Труды VI Международной конференции "Математическая биология и биоинформатика", г. Пущино, 16-21 октября 2016 г., 2 с.
5. Сенотрусова С.Д. Численное моделирование динамики сети онкомаркеров p53-микроРНК // Материалы XVII Всероссийской конференции молодых ученых по математическому моделированию и информационным технологиям, Новосибирск, 30 октября-3 ноября 2016 г., с. 65-66.
6. Воропаева О.Ф., Шокин Ю.И., Сенотрусова С.Д. Численное моделирование функционирования сети онкомаркеров // Труды международной научно-технической конференции «Информационные технологии и математическое моделирование систем», Одинцово, 21-24 ноября 2016 г., с. 17-19.
7. Сенотрусова С.Д. Численный анализ диагностических свойств онкомаркеров // Материалы 55-й международной научной студенческой конференции, Новосибирск, 17-20 апреля 2017г., с. 171.
8. Сенотрусова С.Д., Воропаева О.Ф. Численный анализ диагностических свойств 53-зависимых микроРНК // Тезисы международной конференции Марчуковские научные чтения – 2017, 25 июня-14 июля 2017 г., Новосибирск, с. 196-197.
9. Senotrusova S.D., Voropaeva O.F. Numerical analysis of the diagnostic properties of tumor markers // Systems Biology and Bioinformatics: the Ninth International Young Scientists School SBB-2017, Abstracts, Russia, 25-30 June, 2017, p. 61-62.
10. Сенотрусова С.Д., Воропаева О.Ф. Численные модели динамики p53-зависимых микроРНК // Тезисы XVI Всероссийской конференции «Распределенные информационно-вычислительные ресурсы. Наука – цифровой экономике», 4-7 декабря 2017, Новосибирск, с. 24.
11. Cенотрусова С.Д., Воропаева О.Ф. Численные модели динамики p53-зависимых микроРНК // Труды XVI Всероссийской конференции «Распределенные информационно-вычислительные ресурсы. Наука – цифровой экономике», 4-7 декабря 2017, Новосибирск, с. 246-252.
12. Сенотрусова С.Д., Воропаева О.Ф. Численный анализ диагностических свойств p53-зависимых микроРНК // Труды международной конференции Марчуковские научные чтения – 2017 г., Новосибирск, с. 795-802.
13. Сенотрусова С.Д. Математические модели динамики p53-зависимых микроРНК // Материалы 56-й Международной научной студенческой конференции, 22-27 апреля 2018 г., Новосибирск. с. 141.
14. Сенотрусова С.Д., Воропаева О.Ф. Численные модели динамики p53-зависимых микроРНК // Материалы Международной научной конференции «Актуальные проблемы прикладной математики», 22-26 мая 2018 г., Нальчик – Эльбрус. с.226.
15. Сенотрусова С.Д. Математические модели динамики р53-зависимых микроРНК // Тезисы выступлений участников Второй Школы молодых ученых MolMod-2018. Компьютерное моделирование структуры и динамики биомолекул. Новосибирск, 28-30 апреля 2018 г. с. 47-48.
16. Voropaeva , Leontiev, Senotrusova, Tsgoev, Shokin Mathematical modeling of degenerative diseases // Abstracts of International Conference on the Methods of Aerophysical Researsch. August, 13-19, 2018, Novosibirsk. p. 297-298.
17. S.D. Senotrusova, O.F. Voropaeva. Mathematicals models of p53-microRNA and their applications // Abstracts of Mathematical Modeling and High-Performance Computing in Bioinformatics, Biomedicine and Biotechnology (MM-HPC-BBB-2018). Novosibirsk: ICG SB RAS, 2018. p. 62.
18. Senchukova S.R., Bayadilov T.V., Gavrilova K.S., Ivanov N.D., Leontiev S.V., Senotrusova S.D., Tsgoev Ch.A., Voropaeva O.F. Mathematical models of p53–microRNA and their applications // 27th EADV Congress. Paris. 12-16 September, 2018. P2157.
19. Воропаева О.Ф., Гаврилова К.С., Сенотрусова С.Д. Минимальные математические модели функционирования белковой сети p53-mdm2-wip1-p21 // Актуальные проблемы прикладной математики, информатики и механики: Сборник трудов Международной научной конференции, Воронеж, 17–19 декабря 2018 г. – Воронеж: Издательство «Научно-исследовательские публикации», 2019. – С. 672-679. ISBN 978-5-6042216-1-7
20. Сенотрусова С.Д. Математические модели динамики р53-сети // Тезисы XIX Всероссийской конференции молодых ученых по математическому моделированию и информационным технологиям. г. Кемерово, Россия 29 октября –2 ноября 2018 г. – Новосибирск: ИВТ СО РАН, 2018. с. 42. ISBN: 978-5-905569-08-1
21. Воропаева О.Ф., Гаврилова К.С., Сенотрусова С.Д. Численное моделирование функционирования системы биомаркеров дегенеративных заболеваний // Тезисы международной конференции «Актуальные проблемы вычислительной и прикладной математики», 1-5 июля 2019 г., Новосибирск, с. 150.
22. Сенотрусова С.Д. Математическое моделирование функционирования р53-сети // Тезисы XX Всероссийской конференции молодых ученых по математическому моделированию и информационным технологиям. г. Новосибирск, Россия, 28 октября – 1 ноября 2019 г. – Новосибирск: ИВТ СО РАН, 2019. с. 42–43. ISBN: 978-5-905569-13-5
23. Воропаева О.Ф., Гаврилова К.С., Сенотрусова С.Д. Математическое моделирование динамики сети биомаркеров дегенеративных заболеваний // Труды XVII Международной конференции «Распределенные информационно-вычислительные ресурсы: Цифровые двойники и большие данные. (DICR 2019)», г. Новосибирск, 3–6 декабря 2019 г. – Новосибирск: ИВТ СО РАН, 2019. С. 185–190. ISBN: 978-5-905569-14-2
24. Сенотрусова С.Д., Воропаева О.Ф. Численный анализ терапевтического потенциала р53-зависимых микроРНК на основе лабораторных данных и минимальных математических моделей // Доклады Международной конференции “Математическая биология и биоинформатика”. Под ред. В.Д. Лахно. Том 8. Пущино: ИМПБ РАН. 2020. Статья № e20. 6 стр. doi: 10.17537/icmbb20.18
25. Voropaeva O.F., Bayadilov T.V., Senotrusova S.D., Tsgoev C.A. Mathematical modeling of the mechanisms of Socially significant diseases // Abstracts International Conference Dedicated To The 1150th Anniversary Of The Great Philosopher And Mathematician Al-Farabi «Computational And Information Technologies In Science, Engineering And Education», 9-10 Okt. 2020, Алматы (CITECH-2020). 2020. P. 23.
26. Сенотрусова С.Д., Воропаева О.Ф. Минимальные математические модели функционирования системы p53–микроРНК // Марчуковские научные чтения 2020: Тезисы Междунар. конф., посв. 95-летию со дня рождения акад. Г. И. Марчука Новосибирск, 19‒23 октября 2020 г. / Ин-т вычислит. математики и матем. геофизики СО РАН. Новосибирск: ИПЦ НГУ, 2020. С. 169
27. Сенотрусова С.Д. Применение минимальных математических моделей к анализу терапевтического потенциала р53-зависимых микроРНК на основе лабораторных данных // Тезисы XXI Всероссийской конференции молодых ученых по математическому моделированию и информационным технологиям. г. Новосибирск, Россия 7–11 декабря 2020 г. С. 19.
28. Воропаева О. Ф., Гаврилова К. С., Сенотрусова С. Д. Математическое моделирование противораковых терапевтических воздействий // Сб. трудов Международной конференции «Актуальные проблемы прикладной математики, информатики и механики». – Воронеж, 2021. – С. 789–796. 29. Сенотрусова С. Д. Применение минимальных математических моделей к исследованию механизмов функционирования системы биомаркеров дегенеративных заболеваний // Тезисы XXII Всероссийской конференции молодых ученых по математическому моделированию и информационным технологиям. – Новосибирск, 2021. – С. 29. 30. Воропаева О. Ф., Сенотрусова С. Д. Математическое моделирование функционирования системы биомаркеров дегенеративных заболеваний // Материалы VI Международной научной конференции «Нелокальные краевые задачи и родственные проблемы математической биологии, информатики и физики». – Нальчик, 2021. – С. 57.

Устный доклад на зарубежной конференции (дальнее зарубежье)
нет

Устный доклад на международной конференции
1. Сенотрусова С.Д. Численный анализ диагностических свойств p53-зависимых микроРНК // Международная конференция Марчуковские научные чтения – 2017, 25 июня-14 июля 2017 г., Новосибирск.
2. Сенотрусова С.Д. Численные модели динамики p53-зависимых микроРНК // Международная научная конференция «Актуальные проблемы прикладной математики», 22-26 мая 2018 г., Нальчик – Эльбрус.
3. Сенотрусова С.Д. Mathematicals models of p53-microRNA and their applications // Mathematical Modeling and High-Performance Computing in Bioinformatics, Biomedicine and Biotechnology (MM-HPC-BBB-2018). Novosibirsk: ICG SB RAS, 2018
4. Сенотрусова С.Д. Численное моделирование функционирования системы биомаркеров дегенеративных заболеваний // Международная конференция «Актуальные проблемы вычислительной и прикладной математики», 1-5 июля 2019 г., Новосибирск.
5. Сенотрусова С.Д. Математическое моделирование динамики сети биомаркеров дегенеративных заболеваний // XVII Международная конференция «Распределенные информационно-вычислительные ресурсы: Цифровые двойники и большие данные. (DICR 2019)», 3–6 декабря 2019 г., Новосибирск. 6. Сенотрусова С. Д. Математическое моделирование функционирования системы биомаркеров дегенеративных заболеваний // VI Международная научная конференция «Нелокальные краевые задачи и родственные проблемы математической биологии, информатики и физики», 5–9 декабря 2021 г., Нальчик. 7. Сенотрусова С. Д. О реализации системно-биологического подхода при моделировании функционирования биомаркеров дегенеративных заболеваний // Международная конференция «Актуальные проблемы прикладной математики, информатики и механики», 13–15 декабря 2021 г., Воронеж.

Устный доклад на всероссийской конференции
1. Сенотрусова С.Д. Численное моделирование динамики сети онкомаркеров p53-микроРНК // Всероссийская конференция молодых ученых по математическому моделированию и информационным технологиям, 30 октября-3 ноября 2016 г., Новосибирск.
2. Сенотрусова С.Д. Численные модели динамики p53-зависимых микроРНК // Всероссийская конференция «Распределенные информационно-вычислительные ресурсы. Наука – цифровой экономике», 4-7 декабря 2017, Новосибирск.
3. Сенотрусова С.Д. Математическое моделирование функционирования р53-сети // XX Всероссийская конференция молодых ученых по математическому моделированию и информационным технологиям, 28 октября – 1 ноября 2019 г., Новосибирск. 4. Сенотрусова С.Д. Применение минимальных математических моделей к исследованию механизмов функционирования системы биомаркеров дегенеративных заболеваний // XXII Всероссийская конференция молодых ученых по математическому моделированию и информационным технологиям, 25–29 октября 2021 г., Новосибирск.

Устный доклад на молодежной конференции
1. Сенотрусова С.Д. Численное моделирование функционирования сети онкомаркеров // 54-я Международная научная студенческая конференция, 16-20 апреля 2016 г., Новосибирск.
2. Сенотрусова С.Д. Численный анализ диагностических свойств онкомаркеров // 55-я Международная научная студенческая конференция, 17-20 апреля 2017 г., Новосибирск.
3. Сенотрусова С.Д. Математические модели динамики p53-зависимых микроРНК // 56-я Международная научная студенческая конференция, 22-27 апреля 2018 г., Новосибирск.

Стендовый доклад
нет

Награды (Дипломы, сертификаты, прочие виды наград)
1. Призер (диплом первой степени) Международной научной студенческой конференции МНСК-2016.
2. Призер (диплом первой степени) Международной научной студенческой конференции МНСК-2017.

Участие в олимпиадах
нет

Стипендия (Президента РФ и пр.)
1. Стипендиат им. академика Н.Н. Яненко (2016).
2. Стипендиат компании Baker Hughes (2017).
3. Стипендиат компании Baker Hughes (2018).
4. Стипендиат Правительства РФ (2019)

Руководитель проекта (РФФИ, ФЦП и пр.)

№ п/п Тема гранта Название фонда/организации Руководитель Участники Номер гранта

Исполнитель гранта

№ п/п Тема гранта Название фонда/организации Руководитель Номер гранта
         
         

Стажировка

№ п/п Название стажировки Страна и место прохождениия Период прохождения Результат

Удостоверение о повышении квалификации
нет

Патенты
Свидетельство о государственной регистрации программы для ЭВМ №2018612326 «Программа для расчета динамики онкомаркеров p53 и Mdm2 и оценки реакции p53-зависимых микроРНК на стрессовые воздействия» (от 15.02.18)

Другие достижения (в том числе не научные)

  • спортивная деятельность
  • культурно-творческая деятельность
  • общественная деятельность

ЛИЧНЫЙ КАБИНЕТ