| Инд. авторы: | Кутумова Е.О. |
| Заглавие: | Циклы функционирования дискретной модели регуляторного контура генной сети с пороговыми функциями |
| Библ. ссылка: | Кутумова Е.О. Циклы функционирования дискретной модели регуляторного контура генной сети с пороговыми функциями // Дискретный анализ и исследование операций. - 2011. - Т.18. - № 3. - С.65-75. - ISSN 1560-7542. |
| Внешние системы: | РИНЦ: 16441562; |
| Реферат: | rus: Найден новый класс циклов функционирования дискретной модели регуляторного контура генной сети с пороговыми функциями. Получено описание циклов класса в зависимости от значения параметра p - весового порога значений функций и n - числа вершин сети. Доказаны критерий p-собственности и теорема о сводимости описания циклов для произвольного p > 3 к описанию 4-собственных циклов и наследственных циклов при p = 3. eng: The paper describes a new class of cycles of the functional graphs identified by the discrete models of the gene network regulatory circuits with the threshold functions. A description of the class of cycles is obtained depending on the value of p which is the threshold weight of the functions values and the number of the network vertices n. P-property criterion is proved as well as the theorem of reducibility of the cycles description for any p > 3 to the description of 4-property cycles and hereditary cycles for p = 3. |
| Ключевые слова: | discrete model; Regulatory circuit; functional graph cycle; threshold function; генная сеть; дискретная модель; пороговая функция; цикл функционирования; регуляторный контур; gene network; |
| Издано: | 2011 |
| Физ. характеристика: | с.65-75 |
| Цитирование: | 1. Григоренко E. Д., Евдокимов А. А., Лихошвай В. А., Лобарева И. А. Неподвижные точки и циклы автоматных отображений, моделирующих функционирование генных сетей//Вестн. ТГУ. -2005. -T. 14. -C. 206-212. 2. Евдокимов А. А., Лиховидова Е. О. Дискретная модель генной сети циркулянтного типа с пороговыми функциями//Вестник Томского государственного университета. Управление, вычислительная техника и информатика. -2008. -Т. 2, № 3. -C. 18-21. 3. Лихошвай В. А., Голубятников В. П., Демиденко Г. В., Евдокимов А. А., Матвеева И. И., Фадеев С. И. Теория генных сетей//Системная компьютерная биология. -Новосибирск: Изд-во СО РАН, 2008. -C. 397-480. 4. Оре О. Теория графов. -М.: Наука, 1980. -336 с. 5. Evdokimov A. A., Kutumova E.O. The discrete model of the gene networks regulatory loops with the threshold functions//Proc. 7th Int. Conf. on bioinformatics of genom regulation and structure (Novosibirsk, June 20-27, 2010). -Novosibirsk: SB RAS, 2010. -P. 155. 6. Kauffman S. A., Smith R. G. Adaptive automata based on Darwinian selection//Physica D. -1986. -Vol. 22, N 1-3. -P. 68-82. 7. Kauffman S. A. At home in the universe: the search for the laws of self-organization and complexity. -Oxford: Oxford Univ. Press, 1995. -321 p. 8. Komarov A. V., Akberdin I.R., Ozonov E.A., Evdokimov A. A. On the reconstruction of a genetic automation on the basis of Boolean dynamic data//Proc. 5th Int. Conf. on bioinformatics of genom regulation and structure (Novosibirsk, July 16-22, 2006). Vol. 3. -Novosibirsk: SB RAS, 2006. -P. 69-73. 9. Kutumova E. O., Evdokimov A. A. Reversible states of the functioning of regulatory circuits discrete models of gene networks//Вестник Томского государственного университета. Управление, вычислительная техника и информатика. -2011. -T. 14, № 1. -C. 85-94. |
