Целью дипломной работы является ознакомление с алгоритмом Смита-Ватермана и его открытыми имплементациями и создание собственной реализации с учетом таких современных достижений в области вычислительной техники, как многопоточность и расширенного набора векторные инструкции. В результате работы создана и протестирована оптимизированная версия алгоритма Смита-Ватермана. Код будет открыт для бесплатного использования и оформлен в виде готового к использованию инструмента.