Программный комплекс BioUML и его использование для моделирования биологических систем и анализа генетических данных

(по материалам докторской диссертации)

Семинар: Информационные технологии
Начало заседания: 14:35

Дата выступления: 28 Декабрь 2021

Организация: ФИЦ информационных и вычислительных технологий (Новосибирск)

Авторы: Колпаков Федор Анатольевич

Цель данной работы – разработка методологии и инструментария (программный комплекс и базы данных) для эффективного создания и использования сложных модульных моделей биологических систем и анализа генетических данных.

Для достижения этой цели были поставлены и решены следующие задачи:

1.     Разработать методологию для эффективного создания и использования сложных модульных моделей биологических систем.

2.     Разработать программный комплекс, реализующий весь инструментарий, необходимый для успешного использования предложенной методологии.

3.     Продемонстрировать возможности разработанной методологии и программного комплекса для создания и использования сложных моделей биологических систем, включая:

‒       модель клетки (виртуальная клетка) и основных процессов, происходящих в ней (метаболизм, транскрипция, трансляция, гликозилирование, отдельные пути передачи сигнала, апоптоз);

‒       модель физиологии человека и биохимии человека;

‒       модели воздействия лекарственных препаратов на отдельных пациентов (виртуальный пациент).

4. Как часть программного комплекса разработать систему для анализа генетических данных при помощи сценариев.

 

-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------

Трансляция семинара будет осуществляться на платформе BigBlueButton по ссылке: https://vcs-3.ict.sc/b/nmm-jge-zjd