Явление хаоса в математической модели альтернативного сплайсинга

Семинар: Информационно-вычислительные технологии
Начало заседания: 16:00

Дата выступления: 26 Апрель 2016

Организация: ИМ СО РАН, ИЦиГ СО РАН (Новосибирск)

Авторы: к.ф.-м.н Когай Владислав Владимирович, д.ф.м.н. Фадеев С.И., д.б.н. Хлебодарова Т.М., д.б.н. Лихошвай В.А.

Изучена хаотическая динамика в моделях альтернативного сплайсинга (сплайсинг — процесс вырезания определенных нуклеотидных последовательностей из молекул РНК и их соединения в определенную последовательность). Найден пример, в котором показана возможность перехода к хаотической динамике по всем известным основным сценариям. К ним относятся переходы к хаосу: по сценарию Фейгенбаума, через последовательность бифуркаций удвоения периода; по сценарию Рюэлля—Такена через квазипериодические режимы; по сценариям Помо—Манневиля через перемежаемость I, II и III типа. Описаны параметрические особенности каждого типа перехода к хаосу. Найденная модель является единственным известным нам примером, демонстрирующим все классические сценарии перехода к хаотической динамике. Впервые прогнозируется, что переход к хаосу по II типу перемежаемости может быть реализован в биологической системе.

Литература
Likhoshvai VA., Fadeev S.I., Kogai V.V., Khlebodarova T.M. On the chaos in gene networks //J. Bioinform. Сomput. Вiol., 2013, V.11, №1, 1340009.
Likhoshvai V.A., Kogai V.V., Fadeev S. I., Khlebodarova T.M. Alternative splicing can lead to chaos // J. Bioinform. Сomput. Вiol., 2015, V.13, №1, 1540003.
Когай В.В., Хлебодарова Т.М., Фадеев С.И., Лихошвай В.А. Сложная динамика в системах альтернативного сплайсинга мРНК: математическая модель // Вычислительные технологии, 2015, Т.20, №1, С.38-52.