Поиск значимых регуляторных мутаций (SNV), связанных с регуляцией генной экспресии (eQTL)

Семинар: Информационно-вычислительные технологии в медицине и биологии
Начало заседания: 16:00

Дата выступления: 21 Июнь 2018

Организация: ИВТ СО РАН

Авторы: Колпаков Федор Анатольевич

Большинство мутаций находятся в некодирующих районах генов и могут влиять на регуляцию генной экспресии.
Сейчас активно разрабатываются алгоритмы, которые позволяют предсказать, может ли влиять конкретная мутация,
на регуляцию экспресии заданного гена в заданной ткани. В докладе будут рассмотрена постановка задачи,
доступные ресурсы (www.gtexportal.org), некоторые алгоритмы и планы по их использованию для развития
базы данных GTRD.