Кутумова Елена Олеговна
Ученая степень:
кандидат физико-математических наук
Должность:
старший научный сотрудник
Почта:
e.o.kutumova@gmail.com
Публикации (22)
Источник: | Год: | Есть в: | Тип: | Порция: |
№ | Индекс | Год | Библиографическая ссылка ( всего 22, показано с 1 ) |
---|---|---|---|
1 | 66544 | 2022 | Kolpakov F., Akberdin I.R., Kiselev I.N., Kolmykov S.K., Kondrakhin Y., Kulyashov M., Kutumova E.O., Pintus S.S., Ryabova A., Sharipov R.N., Yevshin I.S., Zhatchenko S., Kel A. BioUML - towards a universal research platform // Nucleic Acids Research. - 2022. - Vol.50. - Iss. W1. - P.W124-W131. - ISSN 0305-1048. - EISSN 1362-4962. |
2 | 66681 | 2022 | Kolpakov F.A., Kiselev I.N., Kutumova E.O., Akberdin I.R., Ryabova A.S., Yevshin I.S., Sharipov R.N., Zhatchenko S.A. Sirius platform as environment for evolutionary development of mathematical models of complex biological systems // Bioinformatics of genome regulation and structure/systems biology (BGRS/SB-2022): Abstracts the Thirteenth International Multiconference. Новосибирск, 04–08 июля 2022 года. - 2022. - Новосибирск: ФИЦ ИЦиГ СО РАН. - P.214. - ISBN: 978-5-91291-059-3. |
3 | 66623 | 2022 | Kutumova E.O., Akberdin I.R., Kiselev I.N., Sharipov R.N., Egorova V.S., Syrocheva A.O., Parodi A., Zamyatnin A.A., Kolpakov F.A. Physiologically Based Pharmacokinetic Modeling of Nanoparticle Biodistribution: A Review of Existing Models, Simulation Software, and Data Analysis Tools // International Journal of Molecular Sciences. - 2022. - Vol.23. - Iss. 20. - Art.12560. - ISSN 1661-6596. - EISSN 1422-0067. |
4 | 66516 | 2022 | Kutumova E.O., Akberdin I.R., Kiselev I.N., Sharipov R.N., Kolpakov F.A. Modular Representation of Physiologically Based Pharmacokinetic Models: Nanoparticle Delivery to Solid Tumors in Mice as an Example // Mathematics. - 2022. - Vol.10. - Iss. 7. - Art.1176. - EISSN 2227-7390. |
5 | 66687 | 2022 | Колпаков Ф.А., Кутумова Е.О., Акбердин И.Р., Рябова А.С., Евшин И.С., Жатченко С.А. Sirius-web - среда для эволюционного создания математических моделей сложных биологических систем // Международная конференция «Прикладная математика иммунологии и вирусологии», Сочи, Россия, 14-18 ноября 2022 года. Программа. - 2022. - Сочи: Университет «Сириус». - С.53-56. - https://siriusmathcenter.ru/pr_img/1918100371/20221112/62063230/Program_027w.pdf |
6 | 66090 | 2021 | Kutumova E., Kiselev I., Sharipov R., Lifshits G., Kolpakov F. Thoroughly Calibrated Modular Agent-Based Model of the Human Cardiovascular and Renal Systems for Blood Pressure Regulation in Health and Disease // Frontiers in Physiology. - 2021. - Vol.12. - Art.746300. - EISSN 1664-042X. |
7 | 63932 | 2019 | Kolpakov F., Akberdin I., Kashapov T., Kiselev I., Kolmykov S., Kondrakhin Y., Kutumova E., Mandrik N., Pintus S., Ryabova A., Sharipov R.N., Yevshin I., Kel A. BioUML: an integrated environment for systems biology and collaborative analysis of biomedical data // Nucleic Acids Research. - 2019. - Vol.47. - Iss. W1. - P.W225-W233. - ISSN 0305-1048. - EISSN 1362-4962. |
8 | 63908 | 2019 | Киселев И.Н., Кутумова Е.О., Колпакова А.Ф., Колпаков Ф.А. Виртуальный пациент // Биотехнология: состояние и перспективы развития: Материалы международного конгресса (Москва, 25.02-27.02.2019). Выпуск 17. - 2019. - Москва: Общество с ограниченной ответственностью "Русские Экспо Дни Групп". - С.339-341. - ISBN: 978-5-9909118-0-2. |
9 | 63907 | 2019 | Киселев И.Н., Кутумова Е.О., Колпакова А.Ф., Лифшиц Г.И., Колпаков Ф.А. Математическое моделирование действия антигипертензивных препаратов // Математическая биология и биоинформатика. - 2019. - Т.14. - № 1. - С.233-256. - EISSN 1994-6538. |
10 | 63910 | 2019 | Колпаков Ф.А., Киселев И.Н., Кутумова Е.О., Колпакова А.Ф., Лифшиц Г.И. Виртуальный пациент: разработка технологии на примере модульной математической модели сердечно-сосудистой системы человека и предсказание эффективности лечения артериальной гипертензии // Биотехнология - медицине будущего: Материалы всероссийской мультиконференции с международным участием (Новосибирск, 29.06-02.07.2019). - 2019. - Новосибирск. - С.74. - ISBN: 978-5-85957-150-6. |
11 | 58430 | 2016 | Kutumova E.O., Yevshin I.S., Basmanova E., Mandrik N., Sharipov R.N., Kolpakov F.A. Population-based mathematical modeling of human immunoglobulin G N-glycosylation // Proceedings of The Second International Conference “Mathematical Modeling and High Performance Computing in Bioinformatics, Biomedicine and Biotechnology” (within BGRS\SB-2016): Novosibirsk, Russia. 29 August – 2 September 2016. - 2016. - Novosibirsk. - P.69. - ISBN: 978-5-91291-028-9. |
12 | 58431 | 2016 | Mandrik N., Kutumova E.O., Kolpakov F.A. Rule-based modeling in BioUML // Proceedings of The Second International Conference “Mathematical Modeling and High Performance Computing in Bioinformatics, Biomedicine and Biotechnology” (within BGRS\SB-2016): Novosibirsk, Russia. 29 August – 2 September 2016. - 2016. - Novosibirsk. - P.72. - ISBN: 978-5-91291-028-9. |
13 | 58400 | 2013 | Kutumova E.O., Ryabova A., Valeev T.F., Kolpakov F. BioUML plug-in for nonlinear parameter estimation using multiple experimental data // Virtual Biology. - 2013. - Vol.1. - P.47-58. - EISSN 2306-8140. |
14 | 57468 | 2012 | Kutumova E.O. The cycles of functioning of a discrete model of a regulatory circuit of a gene network with threshold functions // Journal of Applied and Industrial Mathematics. - 2012. - Vol.6. - Iss. 2. - P.203-209. - ISSN 1990-4789. - EISSN 1990-4797. |
15 | 57505 | 2012 | Kutumova E.O., Kiselev I.N., Sharipov R.N., Kolpakov F.A., Lavrik I.N. A modular model of the apoptosis machinery // Advances in Experimental Medicine and Biology. - 2012. - Vol.736. - P.235-245. - ISSN 0065-2598. |
16 | 58432 | 2012 | Kutumova E.O., Zinovyev A.Y., Sharipov R.N., Kolpakov F.A. The application of model reduction methods to the construction of the composite model of apoptotic pathways // Mathematical Biology and Bioinformatics. - 2012. - Vol.7. - Iss. 2. - P.572-588. - EISSN 1994-6538. |
17 | 57935 | 2012 | Кутумова Е.О. Редукция модели cd95-индуцируемого апоптоза // Математическая биология и биоинформатика. - 2012. - Т.7. - № 1. - С.139-151. - EISSN 1994-6538. |
18 | 57448 | 2012 | Кутумова Е.О., Зиновьев А.Ю., Шарипов Р.Н, Колпаков Ф.А. Применение методов редукции для построения комплексной модели апоптотических путей // Математическая биология и биоинформатика. - 2012. - Т.7. - № 2. - С.572-588. - EISSN 1994-6538. |
19 | 58386 | 2011 | Kiselev I.N., Kutumova E.O., Sharipov R.N., Kolpakov F.A. BioUML Plugin for Modular Modeling // 12th International Conference on Systems Biology-2011: Heidelberg, Germany, Aug 28th – Sep 1st. - 2011. - P.229. - ISBN: 978-1-62276-064-0. |
20 | 58389 | 2011 | Kolpakov F.A., Tolstykh N.I., Valeev T.F., Kiselev I.N., Kutumova E.O., Ryabova A., Yevshin I.S., Kel A. Bio-UML open source plug-in based platform for bioinformatics: invitation to collaboration // Proceedings of The International Moscow Conference on Computational Molecular Biology: book of abstracts. - 2011. - P.172-173. |
Проекты (3)
020 - Фундаментальные научные исследования (базовые темы)
- 122010800028-4 (ЕГИСУ) (2022-01-01 - 2024-12-31)
Базовая тема № 3 «Разработка и анализ информационных и вычислительных технологий в задачах мониторинга и создания цифровых двойников различных явлений и объектов» - АААА-А17-117120670141-7 (2017-01-01 - 2020-12-31)
Базовая тема № 2 «Теоретические основы, алгоритмическое обеспечение и информационные технологии для решения фундаментальных и прикладных задач исследования сложных техногенных, природных и биологических систем»
- 122010800028-4 (ЕГИСУ) (2022-01-01 - 2024-12-31)
040 - Российский научный фонд
040.010 - Проведение фундаментальных научных исследований и поисковых научных исследований отдельными научными группами
- 19-14-00295 (2019-05-01 - 2021-12-31)
Интеграция и анализ омиксных данных по регуляции транскрипции, оценка влияния SNV
- 19-14-00295 (2019-05-01 - 2021-12-31)
Конференции (7)
Автор доклада
- Международная конференция «Прикладная математика иммунологии и вирусологии». - (2022-11-14 - 2022-11-18). - Сочи. - Россия
- BGRS/SB-2022 - Thirteenth International Multiconference Bioinformatics of genome regulation and structure/systems biology. - (2022-07-04 - 2022-07-08). - Novosibirsk. - Russia
- Всероссийская мультиконференция с международным участием "Биотехнология - медицине будущего". - (2019-06-29 - 2019-07-02). - Новосибирск. - Россия
- Биотехнология: состояние и перспективы развития. - (2019-02-25 - 2019-02-27). - Москва. -
- MM-HPC-BBB-2016 - International Conference «Mathematical Modeling And High Performance Computing In Bioinformatics, Biomedicine And Biotechnology». - (2016-08-29 - 2016-09-02). - Novosibirsk. - Russia
- 12th International Conference on Systems Biology-2011. - (2011-08-28 - 2011-09-04). - Heidelberg. - Germany
- International Moscow Conference on Computational Molecular Biology–2011. - (2011-07-21 - 2011-07-24). - Moscow. - Russia